Die Fakultäten sind die organisatorischen Grundeinheiten der Hochschule und erfüllen in ihrem Bereich die Aufgaben der Hochschule. Der Fakultät Agrarwissenschaften sind derzeit 51 Professuren zugeordnet.
Der Fakultätsrat und der Fakultätsvorstand sind die beiden wichtigsten Organe der Fakultät. Der Dekan vertritt, der Fakultätsvorstand leitet die Fakultät. Der Fakultätsrat berät in allen Angelegenheiten von grundsätzlicher Bedeutung.